215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1122 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  36.52 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.97 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.48 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  35.65 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.95 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.93 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.93 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.61 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.28 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.1 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.89 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.43 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.67 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  33.7 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  23.81 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.71 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.25 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.71 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  31.53 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  26.42 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  26.42 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.24 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  40.32 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  40.32 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  28.28 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  24.07 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  21.43 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  26.21 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  21.82 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  22.22 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  28.05 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  23.81 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  22.64 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.81 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.59 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.81 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  39.06 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.81 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  26.17 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  22.32 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>