More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0628 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  224  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  42.99 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  41.74 
 
 		 117 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  45.28 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  43.81 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  37.61 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  42.86 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.39 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  37.61 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  41.28 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.62 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  35.78 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.78 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.01 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 111 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  36.08 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  29.29 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  29.29 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.11 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  40.45 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.36 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  41.67 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.96 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  28.83 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  33.01 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.46 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  26.04 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  52.7 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  24.74 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.49 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.78 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.11 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 121 aa  57  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>