215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1096 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 103 aa  203  8e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.71 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  40.45 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.96 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.9 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.41 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.66 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.87 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.06 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.93 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  34.02 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  28.71 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.63 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  29.29 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.93 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.57 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.57 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  28.57 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.96 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.85 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.45 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  35.37 
 
 		 429 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  23.47 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.59 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  29.29 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  31.76 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  31.76 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  31.76 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.81 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.72 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  27 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>