230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1795 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  100 
 
 		 110 aa  214  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  49.09 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  47.66 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  47.66 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  42.99 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 		 111 aa  87  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  38.32 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 111 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.51 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  41.05 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  35.34 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  37.96 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40.57 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 		 249 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 		 116 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  31.37 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  39 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.26 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 436 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  32.43 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  34.69 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.41 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  31.13 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.48 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.67 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03912  anti-sigma F factor antagonist  37.37 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  27.52 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.3 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  26.85 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  35.71 
 
 		 782 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1259  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.92 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.04 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.42 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  25.74 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  37.08 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.92 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.92 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  27 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.92 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  32.04 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.96 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>