137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3003 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 130 aa  256  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  85.38 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  59.84 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  59.84 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  66.67 
 
 		 99 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  50.96 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  54.37 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  45.92 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  40.87 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  41.05 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.25 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  25.22 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2807  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  25.22 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.36 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  26.32 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  29.71 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  26.6 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.36 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 		 340 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.97 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  34.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  33.7 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.17 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  24.51 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  23 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25.45 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.16 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  42.59 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  26.09 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.43 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28 
 
 		 437 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.1 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.53 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  23.4 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.91 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>