195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3990 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  230  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30.93 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  31.33 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  42.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  35 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.8 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  32.53 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3679  hypothetical protein  39 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.24 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.24 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.52 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.02 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  36.46 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30.11 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.18 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  42.53 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  35.56 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.86 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  37.04 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  26.17 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  30.12 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.7 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  35.16 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.77 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  29.29 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.08 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  28.77 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  35.79 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  27.37 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.18 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.53 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.88 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.77 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  21.43 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  32.35 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  42.47 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  21.78 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.58 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>