39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3325 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  51.69 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  46.28 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4919  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0508349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  36.9 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.43 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3599  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.58 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  33.63 
 
 		 505 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.94 
 
 		 114 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 157 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.12 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3994  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  37.29 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121184  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  24.75 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0393  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.84 
 
 		 109 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00214787  normal  0.11292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>