20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3994 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3994  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121184  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  42.62 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1305  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427492  decreased coverage  0.000306808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  31.87 
 
 		 505 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  40.28 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  33.8 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 117 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  39.66 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  37.25 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  37.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  37.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  37.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>