230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0861 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
116 aa  228  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  51.89 
 
 
111 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
112 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  51.09 
 
 
113 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  48.94 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  40.21 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  35.92 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  35.92 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  33.64 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  37.38 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  36.36 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.35 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  44.71 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.64 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  38.2 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  32.26 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  30.85 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
111 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  31.52 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.65 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.69 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.7 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.85 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.75 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
122 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
120 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
120 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  34.04 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  35.19 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4673  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.65 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  39.02 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>