256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3905 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
116 aa  230  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  97.41 
 
 
116 aa  226  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  97.41 
 
 
116 aa  226  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  96.55 
 
 
116 aa  224  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  89.66 
 
 
116 aa  208  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  73.28 
 
 
116 aa  176  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  69.83 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  47.47 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  47.47 
 
 
111 aa  104  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  42.34 
 
 
120 aa  100  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  42.73 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  39.64 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  44.55 
 
 
112 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  43.3 
 
 
115 aa  93.6  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  40.54 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.96 
 
 
110 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.55 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  36.54 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  37.86 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  35.58 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  34.62 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.73 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.38 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  29.46 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.62 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
250 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.65 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
108 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  33.65 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.65 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.65 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  32.69 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  24.11 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.63 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  31.62 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.51 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.32 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.25 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  36.9 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  29.81 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  32.2 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.07 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  24.78 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>