168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0811 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  100 
 
 
121 aa  238  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  57.02 
 
 
114 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.66 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.82 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.05 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  39.05 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2076  anti-anti-sigma factor family protein  42.86 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  39.81 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  36.54 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  34.82 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  35 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  19.8 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.31 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 
110 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.26 
 
 
118 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
111 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.72 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27.66 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7543  hypothetical protein  37.97 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 
125 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.91 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24.75 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  33.78 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  36.62 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  31.09 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.49 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
110 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
115 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4115  anti-sigma-factor antagonist  36.71 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231593  normal  0.0203819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  25.89 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.73 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.18 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3325  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3387  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.630266  normal  0.0247745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3336  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481518  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  22 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>