157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1873 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  45.28 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  45.28 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  45.28 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40.74 
 
 		 110 aa  84.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  46.07 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  38.78 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  39.78 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.36 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40.23 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  39.76 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.19 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.41 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.43 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 436 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  34.44 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.9 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  29.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  29.17 
 
 		 782 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 250 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.28 
 
 		 437 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  24.78 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.32 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  30.43 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  23.89 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.19 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.59 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  29.21 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 111 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  22.12 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 111 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.21 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.41 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 		 117 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  28.09 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>