114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5017 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  39.82 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  33 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  33 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  41.46 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29.52 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  32 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  32 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  32 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.32 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  31 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  31 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  31 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  32.26 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.56 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  31 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.1 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.1 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  27.27 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 405 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  24.27 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 249 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  28 
 
 		 782 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  19.63 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  22.33 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.12 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  27.03 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.73 
 
 		 437 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  21.9 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.08 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  25.58 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.37 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  24.04 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  27.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  20.75 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  24.76 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  41.07 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  21.82 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  20.95 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.12 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.95 
 
 		 429 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  29.17 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  27.17 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 190 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  21.57 
 
 		 122 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 106 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.08 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  27.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>