152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2436 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  49.09 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  42.45 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.2 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  40 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.76 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.76 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.18 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 436 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  35.19 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  32.99 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  31.25 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  31.31 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.59 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  37.27 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.48 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.25 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29.29 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.29 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  24.53 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.1 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.3 
 
 		 437 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  38.14 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  38.24 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.52 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  35.71 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.53 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.69 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5015  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.69 
 
 		 429 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>