252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1838 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  236  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  46.23 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  41.35 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  37.74 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.91 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  35.05 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  34.38 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  37.23 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  43.84 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.1 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.7 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.17 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.29 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  27.36 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.19 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.42 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.97 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.97 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.56 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.97 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.97 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.32 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.48 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.97 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.47 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.97 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  26.97 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.44 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.47 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.43 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.84 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  28.42 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.87 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>