165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1829 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  60.34 
 
 		 117 aa  150  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  65.18 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  50.88 
 
 		 117 aa  117  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  40.22 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  41.11 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  41.3 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.83 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.73 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.32 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  24.79 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.96 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  33.68 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  25.45 
 
 		 117 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  32.41 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.96 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.18 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.19 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.91 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.28 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  34.33 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  25.44 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  29.2 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.47 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  23.89 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  28.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  26.96 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  41.79 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.32 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  29.23 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  24.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.42 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.69 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  27.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  22.52 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.72 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  35.06 
 
 		 505 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>