109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0182 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.63 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  40.26 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  40.26 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.67 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  31.82 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.07 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.52 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  42.68 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  28.83 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.56 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  36.62 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.14 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.67 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.84 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.92 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.25 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  38.6 
 
 		 350 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.88 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  28.24 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  33.87 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.03 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28.41 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  31.08 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0791  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 111 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 110 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.25 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  29.07 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  29.07 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  30.23 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  25 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  28.24 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>