57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3127 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
109 aa  207  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30.56 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  42.27 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.52 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.78 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  36.62 
 
 
112 aa  48.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  38.39 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.73 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 
107 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
107 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  40.28 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  36 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
142 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.21 
 
 
129 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  37 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  32.11 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  34.85 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  31.11 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  31.11 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>