155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1702 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  100 
 
 		 113 aa  219  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  38.67 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  42.31 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.31 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  29.81 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.21 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  37.31 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.73 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.85 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  23.85 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4224  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.57 
 
 		 285 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.21 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  26.67 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.77 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.86 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  30.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1663  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1736  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.36 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.25 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.94 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.25 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  26.92 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.79 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  31.82 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.73 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  33.73 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.25 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  33.73 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  23.85 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  33.73 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.44 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.05 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  32.89 
 
 		 505 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>