45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0471 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  236  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.69 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.39 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.65 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  30.38 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  31.63 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.73 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  26.6 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  31.68 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  37.25 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.73 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  32 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  24.47 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 117 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  29.41 
 
 		 106 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.11 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.42 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  33.72 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  21.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  32.05 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  33.75 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>