38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4229 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 100 aa  199  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  61 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  57.73 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  57.73 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  56.7 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  56.7 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  50.52 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  50.52 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  50.52 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  50.52 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  51.55 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  45.26 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  44.33 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  45.83 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  41.67 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  34.12 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.26 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  27.91 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  27.91 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  27.91 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  27.91 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  26.74 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  32.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  32.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  32.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  27.06 
 
 		 97 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  29.63 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  29.11 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  25.84 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>