30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3339 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  96.81 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  95.74 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  91.49 
 
 		 94 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  78.49 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  57.73 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  52.08 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  56.25 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  45.83 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  51.55 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  45.26 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  43.82 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  37.65 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  37.65 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  35.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  35.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  35.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0983  hypothetical protein  28.4 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  29.41 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>