37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3366 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  52.04 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  45.83 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  47.92 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  44.79 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  47.46 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  32.63 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  29.29 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  32.93 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  32.93 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  32.93 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  30 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  28.28 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  28.28 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  28.28 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  28.28 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  27.47 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>