28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0737 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 100 aa  191  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  61 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  57.73 
 
 		 94 aa  105  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  53.12 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  52.08 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  52.08 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  48.96 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  52.08 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 98 aa  83.6  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  47.92 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  35.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.18 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  38.6 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  29.87 
 
 		 124 aa  40  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.14 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>