41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3627 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  100 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  67.01 
 
 
98 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  67.01 
 
 
98 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  67.01 
 
 
98 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  67.01 
 
 
98 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  67.01 
 
 
98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  62.89 
 
 
97 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  61.86 
 
 
97 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
97 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  41.3 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  40.62 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  39.58 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  39.58 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  39.58 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  41.67 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  38.54 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  35.71 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  34.41 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  32.58 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  31.46 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  35.53 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1752  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  29.41 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  29.41 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  30.93 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  27.47 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  33.87 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.53 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>