62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3804 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  62.5 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  60.42 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  56.7 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  56.7 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  56.7 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  59.14 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  60.82 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  42.71 
 
 		 97 aa  84.3  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  38.54 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  38.54 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  34.04 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  35.16 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  31.91 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  32.97 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  34.07 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  38.27 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  32.97 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  32.5 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  32.97 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  34.78 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  32.53 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.22 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  28.42 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.96 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  30.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.61 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  30.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  30.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  30.68 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4020  hypothetical protein  42.5 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164835  normal  0.180703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  31.58 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.58 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  35 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  26.51 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0983  hypothetical protein  29.11 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  29.76 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  26.73 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>