32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  100 
 
 		 102 aa  196  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  61.76 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  62.38 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  63.37 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  57.43 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59.18 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0962  toluene-tolerance protein  65.31 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0969  anti-sigma-factor antagonist  66.33 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0867  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  64.29 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.991385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4253  anti-sigma-factor antagonist  59.18 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1001  hypothetical protein  66.67 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.78 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  33.72 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  23.86 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  31.46 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 109 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.37 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.93 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.14 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  28.72 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>