28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  93.07 
 
 		 102 aa  183  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  68.32 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  62.38 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  56.44 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  58.16 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0867  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  61.22 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.991385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0962  toluene-tolerance protein  61.22 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4253  anti-sigma-factor antagonist  57.14 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0969  anti-sigma-factor antagonist  61.22 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1001  hypothetical protein  66.67 
 
 		 93 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.36 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.97 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  33.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 97 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  28.42 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.43 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.18 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  23.4 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 113 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.09 
 
 		 98 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>