24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5024 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  93.07 
 
 		 102 aa  183  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  69.31 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  61.76 
 
 		 102 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  58.16 
 
 		 101 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  56.44 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0867  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  60.2 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.991385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4253  anti-sigma-factor antagonist  58.16 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0962  toluene-tolerance protein  60.2 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0969  anti-sigma-factor antagonist  59.18 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1001  hypothetical protein  63.64 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.08 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.26 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.38 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.48 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  27.66 
 
 		 106 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.81 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  23.76 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>