38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1966 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  45.65 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  32.95 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  37.36 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.09 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  34.12 
 
 		 636 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  40.48 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.62 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  37.65 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  32.91 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  36.51 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  29.76 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  29.03 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  31.65 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  33.93 
 
 		 101 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  30.11 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  31.03 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  31.03 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  36.54 
 
 		 106 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>