46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3233 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  98.88 
 
 
636 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  93.26 
 
 
89 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  76.92 
 
 
91 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  76.92 
 
 
91 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  75.82 
 
 
91 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  75.82 
 
 
91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  72.53 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  74.16 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  75.82 
 
 
91 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  75.82 
 
 
91 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  73.86 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  79.07 
 
 
101 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  51.9 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  49.4 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  50 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  50 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  55.7 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.3 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.83 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.15 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.53 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  34.12 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.57 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  45.45 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.5 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.21 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  39.51 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.11 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  33.73 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.21 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0893  NTP-binding protein  46.99 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  31.58 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
117 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  33.82 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  42.59 
 
 
101 aa  40  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  40 
 
 
80 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>