35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0753 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
89 aa  173  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
89 aa  173  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  72.09 
 
 
96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  68.6 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  61.36 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  55.81 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  48.84 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.73 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.19 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  48.15 
 
 
636 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  49.25 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  49.25 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.7 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  42.7 
 
 
103 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  47.76 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  42.22 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  47.76 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  52.63 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  46.99 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  41.38 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.65 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  50.91 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.7 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  47.76 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  47.76 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>