35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0100 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  74.12 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  46.3 
 
 		 636 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.8 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  48.15 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  48.15 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  46.3 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  48.15 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  41.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  41.07 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  36.71 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  42.59 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.8 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.17 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  41.51 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.94 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  39.73 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  39.62 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.51 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.65 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.65 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.08 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  40 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.96 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.12 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>