36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1018 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
96 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  72.09 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  72.09 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  65.91 
 
 
89 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  62.79 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59.3 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  45.16 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.84 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.67 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.19 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  61.11 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.37 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  60.38 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  55.56 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  45.68 
 
 
636 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  50.91 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  50.91 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  42.7 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  40.45 
 
 
103 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  50.91 
 
 
91 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  50.91 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  41.76 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.93 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  42.86 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.72 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.12 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.35 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>