42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3117 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 117 aa  229  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  74.12 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  51.76 
 
 		 636 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  56.96 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  55.7 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  50.56 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  45.92 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  52.27 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  58.23 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  44.94 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  47.19 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.18 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.02 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.33 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  40 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.9 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.02 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.02 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  39.24 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.35 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.53 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.93 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.86 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.86 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.84 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  37.88 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  32.5 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>