28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3397 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.87 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.24 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  35.53 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  35.53 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  39.66 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  35.53 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  39.66 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  35.56 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  34.21 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  33.96 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  34.21 
 
 		 636 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  31.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  34.21 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  34.21 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>