43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3566 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  86.6 
 
 		 97 aa  150  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  74.44 
 
 		 636 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  74.16 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  73.03 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  76.04 
 
 		 101 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  72.94 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  71.76 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  72.94 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  70.33 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  71.76 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  74.12 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  74.12 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  51.25 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  48.78 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  51.9 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  54.72 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50.56 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235733  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  56.6 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49.37 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48.1 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  42.31 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.96 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  37.35 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.59 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50.91 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.99 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.99 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  46.99 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  50.94 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  43.4 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.76 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  31.76 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.96 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0893  NTP-binding protein  45.12 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.75 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.2 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2679  hypothetical protein  31.34 
 
 		 130 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>