38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0690 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 97 aa  190  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  67.82 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2940  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  53.49 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.78 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3389  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.83 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3096  putative signal peptide protein  40.86 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391422  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2402  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.19 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0721  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.73 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0753  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.73 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1018  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.19 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5531  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.02 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  50.85 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  49.18 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  50.85 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  50 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  40.74 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0101  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.02 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  50.91 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.48 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  50.94 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  45.45 
 
 		 636 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0100  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  47.17 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000362736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  47.17 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  47.27 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0419  hypothetical protein  50.85 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2688  hypothetical protein  50.85 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  34.43 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  37.31 
 
 		 85 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>