66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4356 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  70.83 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  70.83 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  70.83 
 
 		 100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  62.77 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  62.77 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  59.14 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  56.12 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  41.3 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  40.22 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  40.22 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  40.22 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  40.22 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  40.22 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  44.09 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  43.82 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  42.7 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  41.57 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  38.2 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  37.36 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  37.36 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  37.36 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  37.36 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  40.23 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  32.95 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.22 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  34.07 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  42.37 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  28.89 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  32.63 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  32.97 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  42.37 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  29.29 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  29.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  28.09 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4020  hypothetical protein  41.46 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164835  normal  0.180703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  28.42 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1159  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.09 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  36.99 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0983  hypothetical protein  29.41 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.68 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25.81 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.81 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.93 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.81 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0690  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.71 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  35.62 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>