42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03654 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  85.85 
 
 		 106 aa  191  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  58.59 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  56.04 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  36.05 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  36.05 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  36.05 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  36.05 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  36.05 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  32.56 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  31.87 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  26.67 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  26.67 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  26.67 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  28.41 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  29.63 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  35.56 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  29.76 
 
 		 102 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  30.93 
 
 		 100 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  31.76 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  31.11 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>