28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0683 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  96.81 
 
 		 94 aa  186  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  94.68 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  91.49 
 
 		 94 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  79.57 
 
 		 94 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  74.47 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  74.47 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  74.47 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  74.47 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  57.73 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  55.21 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  51.55 
 
 		 97 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  44.21 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  41.57 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  36.47 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  37.97 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  34.52 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  34.52 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0983  hypothetical protein  28.4 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 109 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.11 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>