26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0500 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 98 aa  204  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  52.04 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  47.37 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  45.26 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  45.26 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  45.26 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  44.21 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 100 aa  83.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  43.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  43.75 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  30.68 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  30.68 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  30.68 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  30.93 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>