25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0717 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  74.47 
 
 		 94 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  73.4 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  72.34 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  75.27 
 
 		 94 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  50.52 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  48.45 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  49.48 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  46.32 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  34.12 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.82 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>