52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3077 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  52.08 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  45.83 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  51.04 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  46.88 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  43.16 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  44.79 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  35.71 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  35.71 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  35.71 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  36.05 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  29.89 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  32.76 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  30.53 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  31.11 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  32.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  32.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1820  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 113 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  34.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  34.94 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.66 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  29.59 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>