46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3499 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  98.98 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  67.01 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  69.07 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  68.04 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  39.58 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  39.58 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  39.58 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  45.83 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  40.62 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  36.05 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.53 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  34.48 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  33.72 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  31.33 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  27.45 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  30.65 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  32.18 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  28.28 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  34.18 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1820  hypothetical protein  32.43 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.5 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2883  hypothetical protein  29.76 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.190243  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 166 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>