62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3646 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  61.46 
 
 		 97 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  61.46 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  60.42 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  56 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  56 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  56 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  56.12 
 
 		 99 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  45.83 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  45.83 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  45.83 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  45.83 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  44.79 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  41.67 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  42.71 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  31.11 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  30.93 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1169  hypothetical protein  38 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.731709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.56 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0983  hypothetical protein  30.59 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.09 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2705  NTP binding protein  37.78 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  33.33 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  32.97 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  32.58 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  33.71 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  32.58 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  28.42 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  33.73 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  31.46 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0798  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0725  SpoIIAA family protein  34.12 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.09 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  29.67 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1752  hypothetical protein  29.47 
 
 		 101 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1820  hypothetical protein  30.85 
 
 		 101 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  30.49 
 
 		 92 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.04 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  26.14 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  31.46 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3658  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0717  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  32.71 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0726  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0696  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  40.3 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03207  hypothetical protein  29.89 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>