165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0441 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  80.56 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  40.59 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.14 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.64 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  36.17 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  24.04 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2816  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0655921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.68 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.63 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  35.48 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.72 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  41.43 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.04 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  37.74 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.89 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  36.46 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  30.43 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  34.44 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  37.14 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.78 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.75 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  22.02 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  29.17 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.7 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  29.7 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  22.83 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4919  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0508349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.57 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  27.45 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  24.39 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  31.67 
 
 		 351 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  27 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  30.36 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>