68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2243 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.69 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  39.56 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  42.17 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  26.04 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.83 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34950  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  31.18 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0660877  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  29.91 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  42.35 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2466  anti-sigma-factor antagonist  44.3 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  43.82 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.96 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  27.16 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.99 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  40 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  38.6 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  32.79 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.98 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  14.58 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  22.11 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 250 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  38.6 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.77 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  21.7 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 112 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 113 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25 
 
 		 110 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 122 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>