70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2466 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2466  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  230  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  41.28 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  46.67 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.68 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  38.94 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.91 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.29 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  44.94 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.9 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  36.11 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.45 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  50.79 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.17 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.02 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.42 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  27.68 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.08 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.76 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 113 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  41 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  39.68 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>