75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3946 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  223  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  40.78 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  43.43 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  40.4 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  34.34 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  33.67 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  33.65 
 
 		 505 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  30.69 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  37.25 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.43 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  32.63 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  43.28 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.29 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.81 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  26.92 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  37.5 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.63 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  36.92 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  34.04 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.39 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1429  anti-sigma factor antagonist  27.88 
 
 		 131 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.52338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 127 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2472  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 125 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 110 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  23.6 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  28.24 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.39 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.04 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>